诺如病毒镇江株全基因组序列测定与分析

作者：侯莉; 瞿韦; 傅行礼; 高放; 沈权; 彭蘡; 芮志莲

来源：中国卫生标准管理, 2016, 7(15): 150-152.

• 诺如病毒
• 病毒宏基因组
• 全基因组

诺如病毒有高度变异性,序列分析对监测病毒变异具有重要意义,而其全基因组序列依然有限,有鉴于此,本研究采用病毒宏基因组方法对镇江一株诺如病毒进行了全基因组克隆与分析。结果显示,除去5’非编码区和3’poly(A)结构,NOV/CHN/ZJ01毒株全长7509 bp,含有3个开放式阅读框(ORFs)。序列分析显示,本毒株与一株日本人诺如毒株(AB972502)同源性最高,为99%。基于外壳蛋白和Rd Rp核酸序列进化分析表明,NOV/CHN/ZJ01毒株与日本毒株AB972502同属GII-4,然而,他们与其他毒株在GII-4里形成3个不同的Cluster。这表明,本毒株与这株日本毒株具有相同的进化起源。应加大对诺如病毒的监测力度,避免新的流行。

• 出版日期2016
• 单位江苏大学; 溧阳市人民医院; 江苏大学附属医院