翘嘴鳜MyomiRs时空表达特征及靶向Pax7的预测分析

作者:曾维; 朱鑫; 程聪益; 孟杨杨; 张宇; 宾琴; 李灿; 褚武英; 陈韬*
来源:中国水产科学, 2023, 30(08): 933-941.

摘要

MyomiRs为一类肌肉特异性microRNAs (miRNAs),对于肌细胞的增殖和分化具有重要作用。本研究旨在探究翘嘴鳜(Sinipercachuatsi)4种MyomiRs基因(miR-1a、miR-133a-3p、miR-206和miR-499)的时空表达及其在短期饥饿胁迫下的表达特征,并预测分析4种MyomiRs对Pax7的调控作用。应用实时荧光定量PCR检测4种MyomiRs在翘嘴鳜不同组织、胚后不同发育阶段的白肌以及饥饿5d白肌中的表达情况,并利用RNAhybrid对4种MyomiRs与Pax7 mRNA 3′UTR的靶向位点进行预测。结果显示, miR-1a、miR-133a-3p和miR-206在D60 (出膜后60 d)高表达, miR-499在D100高表达。miR-1a和miR-133a-3p在红肌、白肌和心肌中高表达,在其他组织中表达量低。miR-206在红肌和白肌中高表达,在其他组织中表达较量低。miR-499在心肌中表达量较高,在红肌和白肌中的表达量次之,其他组织中表达量低。饥饿5d后4种MyomiRs的表达均显著上升,表明鳜骨骼肌可能对饥饿胁迫做出应激反应,通过上调4种MyomiRs的表达来调节代谢等生理过程。靶基因预测发现miR-1a、miR-133a-3p和miR-206与Pax7的3′UTR存在结合位点,进一步通过荧光定量PCR验证, miR-206和Pax7在翘嘴鳜胚后不同发育阶段以及昼夜节律性的表达趋势相反。本研究结果表明,miR-1a和miR-133a-3p具有肌肉特异性,miR-206和miR-499为肌源性组织中富集型表达。此外, miR-206可能直接调控Pax7的表达,进而调控翘嘴鳜幼鱼时期肌细胞的增殖和分化从而影响肌肉的生长发育。