苋菜WRKY13基因克隆与生物信息学分析

作者：赵梅; 赵芳; 彭丽云; 潘君飞; 张梓浩; 赖钟雄; 刘生财

来源：分子植物育种, 2018, 16(12): 3830-3835.

DOI：10.13271/j.mpb.016.003830

• 苋菜
• WRKY13
• ORF
• 克隆
• 生物信息学

以苋菜试管苗为材料,利用实验室构建的苋菜转录组数据库,筛选出WRKY13基因cDNA序列,对其开放阅读框(ORF)进行克隆验证和生物信息学分析。结果表明,WRKY13基因ORF长度为675 bp,编码224个氨基酸。通过生物信息学预测,该蛋白属于疏水性蛋白,有44个氨基酸位点存在磷酸化修饰;是WRKY蛋白超级家族(WRKY superfamily)的一个成员,存在1个WRKY结合位点;其二级结构由无规则卷曲结构、β折叠组成和α螺旋;蛋白系统进化树分析表明苋菜WRKY13蛋白独立形成一个分支,但与拟南芥、芜菁、烟草、葡萄聚类到一起,说明WRKY13蛋白在生物进化过程中还是比较保守的。本研究获得了苋菜WRKY13基因完整ORF,这为将来深入研究苋菜WRKY13基因功能提供了科学依据,也为研究其调控甜菜红素代谢过程的影响提供参考。

• 出版日期2018
• 单位福建农林大学