杜洛克猪生长性状全基因组关联分析

作者：张哲; 贺金龙; 邓熙; 高宁; 吴海娥; 张豪; 李加琪

来源：广东农业科学, 2014, (14): 139-143.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874x.2014.14.035

• 猪
• 全基因组关联分析
• 候选基因
• 生产性状 pig
• genome-wide association study
• candidate gene
• production traits

对猪全基因组高密度SNP基因型数据及生长性状表型数据进行全基因组关联分析,以期找到影响这些性状的候选基因,更准确地了解这些生长性状的遗传基础。利用Illumina猪60K SNP芯片对191头杜洛克猪进行基因型检测,使用R语言环境下GenABEL软件包提供的单标记回归分析模型,对体重达100 kg日龄(D100)、活体背膘厚(BFT)和活体眼肌面积(LMA)3个生长性状的表型分别进行全基因组关联分析。在D100和LMA2个性状中分别检测到1个基因组水平和6个染色体水平显著关联的SNP,均位于5号染色体;没有检测到与BFT显著相关的SNP。生物信息学分析表明,BTG1和EFCAB6可能是影响生长...

• 出版日期2014
• 单位华南农业大学