针对体系的复杂性、自主性和演化性特点,提出一套能够对体系开展优化设计的流程方法。通过引入联合能力集成与开发系统的需求分析方法对体系进化架构进行改进,提升体系进化架构对需求的获取能力。并在进化算法优化的过程中,对体系级、系统级和子系统级各层设计变量采用一体化编码形式纳入到进化架构中。最后,以海上救援问题作为应用案例,验证了优化设计方法的可行性。