大仓鼠携带汉坦病毒核苷酸序列特征分析

作者：张明霞; 张永振; 李琦; 孙亦晖; 许铮

来源：现代预防医学, 2007, 34(11): 2076-2078.

DOI：10.3969/j.issn.1003-8507.2007.11.028

• 汉坦病毒
• 克隆
• 大仓鼠

[目的]测定从仓鼠亚科宿主动物大仓鼠鼠肺中分离到的汉坦病毒的全S、部分M基因片段的核酸序列,明确其型别。[方法]现场采集鼠肺标本,IFAT筛选阳性鼠肺,分离病毒,用RT-PCR方法扩增,连接入PMD-18T载体,转化至JM109宿主菌。阳性质粒进行测序。[结果]YU62株S基因片段全长1701nt,有一个完整的ORF,起始位置为37nt,终止于1326nt,编码N蛋白429个氨基酸。与HTN-A16株核苷酸同源性最高为99.1%。M片段克隆出1272bp,核苷酸与HTN-SN7有85.6%的同源性。从S片段种系发生树分析来看,YU62归于HTN型H4亚型。从M片段(265￣624bp)种系发生树来看YU62株属于一个HTN的新亚型。[结论]仓鼠携带的汉坦病毒S、M片段进化不平行,YU62可能是在大仓鼠体内发生重排的HTN的新亚型。

• 出版日期2007-6-5
• 单位中国疾病预防控制中心; 河北省疾病预防控制中心; 苏州大学附属第二医院