不同物种Mchr1基因编码区生物信息学分析

作者：马梦云; 李祥龙; 周荣艳; 李兰会

来源：河南农业科学, 2014, (05): 172-175.

DOI：10.15933/j.cnki.1004-3268.2014.05.001

• Mchr1基因
• 编码区
• 生物信息学
• 遗传多样性 Mchr1 gene
• coding region
• bioinformatics
• genetic diversity

采用比较基因组学和生物信息学的方法分析了人、黑猩猩、玻利维亚灰鼠猴、猕猴、蒙眼貂、裸鼢鼠、佛罗里达海牛、小家鼠、小马岛猬共9个物种的黑色素浓集激素受体1(Mchr1)基因编码区(CDS)的遗传多样性,并对其氨基酸序列、蛋白结构等进行预测。结果表明,来自9个物种的44个Mchr1基因序列中共检测到多态位点200个,其中单一多态位点81个,单倍型14种,Mchr1基因CDS在种内表现较为保守,种间则表现出较丰富的遗传多样性。Mchr1蛋白为疏水性蛋白,理论等电点均大于7,肽链的不稳定系数介于36.26~44.21,均较稳定。Mchr1蛋白位于细胞质中。

• 出版日期2014
• 单位河北农业大学