大白菜InDel-PCR反应体系的优化

作者:梁爽; 原玉香; 张晓伟; 薛银鸽; 姚秋菊; 蒋武生; 田保明; 张强; 赵艳艳
来源:河南农业科学, 2012, (09): 110-113.
DOI:10.15933/j.cnki.1004-3268.2012.09.029

摘要

采用CTAB法提取大白菜基因组DNA,利用单因素试验对InDel-PCR反应体系中的dNTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量、模板DNA用量、引物浓度、退火温度、三温循环时间等7个因素进行筛选和优化。结果表明,适用于大白菜InDel-PCR分析的最佳扩增条件为(20μL):dNTPs 0.1mmol/L、Mg2+1.5mmol/L、Taq DNA聚合酶0.4U、模板DNA 105ng、引物浓度0.4μmol/L、退火温度50℃、三温循环时间30s-30s-45s。该体系可用于大白菜遗传多样性分析及遗传图谱构建。

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