贵阳地区常见尸食性蝇类mtDNA分子标记的检测

作者:夏冰; 刘玉铭; 王启燕; 张红玲; 戴佳琳; 刘燚; 吴爱民; 黄江
来源:中国法医学杂志, 2015, 30(03): 244-248.
DOI:10.13618/j.issn.1001-5728.2015.03.005

摘要

目的应用mt DNA中COI(348bp)、COII(637bp)及16Sr DNA(513bp)基因序列鉴定贵阳地区常见尸食性蝇类的种属。方法收集贵阳地区常见尸食性蝇类标本,经形态学分类鉴定后提取胸肌DNA,扩增COI(348bp)、COII(637bp)及16Sr DNA(513bp)基因片段,测序后用DNAMAN 4.0序列分析软件进行序列拼接,NCBI中的BLAST、MEGA 5.2软件包对所得序列分析建立种内及种间进化分歧率,并构建系统发育树。结果 COI种间平均进化分歧率为12.55%,种间范围在3.0%18.6%,种内范围在0%0.7%;COII种间平均进化分歧率为13.73%,种间范围在5.3%21.6%,种内范围在0%0.6%;16Sr DNA种间平均进化分歧率为4.54%,种间范围在0.4%7.6%,种内范围在0%0.4%。结论 COI、COII及16Sr DNA可用于尸食性蝇类的种属鉴定,该方法可作为传统分类方法的补充手段。

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