口蹄疫病毒O型泛亚株VP1蛋白的二级结构及抗原表位预测

作者：李阳; 马园; 王国华; 田普厚; 李成龙; 刘冬冬; 张七斤^*

来源：中国动物检疫, 2021, 38(11): 101-109.

• 口蹄疫病毒
• VP1蛋白
• 理化性质
• 抗原表位

为获得口蹄疫病毒(FMDV) O/PanAsia毒株VP1蛋白的抗原信息,从而为制备多肽疫苗提供理论依据,运用生物信息学软件,对O/PanAsia毒株的结构蛋白VP1理化性质、结构功能以及细胞表位进行分析,预测抗原表位以选择合适肽段。应用ProParam、TMHMM Server、ProScale和SignaIP等在线工具,分析VP1蛋白氨基酸序列,运用计算机技术和分子生物学软件,分析预测VP1蛋白的基本理化性质、结构功能以及可能的B细胞和T细胞抗原表位,筛选B细胞表位肽段并对VP1的两个主要T细胞表位CTL和Th细胞表位进行预测。结果显示:O/PanAsia毒株VP1蛋白的等电点为9.49,相对分子质量为23 520.83;VP1蛋白的B细胞表位为8～23、135～149和193～205位氨基酸。预测该VP1有10个CTL和10个Th细胞抗原表位,表明其具有较好的免疫原性;最终筛选出VP1蛋白的5个CTL和5个Th优势表位。用生物信息学方法预测O/PanAsia毒株VP1蛋白为稳定性蛋白,含有T、B淋巴细胞抗原表位。本研究为FMDV的进一步研究和疫苗制备奠定了基础。

• 出版日期2021
• 单位内蒙古农业大学