低温胁迫下冬小麦东农冬麦1号分蘖节相关EST-SSR信息分析

作者：苍晶; 范博; 宋扬; 许贺; 牟永潮; 于晶; 张达; 王军虹; 孟婧; 朱祥春

来源：东北农业大学学报, 2014, (01): 1-5.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2014.01.001

• 冬小麦
• 东农冬麦1号
• 低温胁迫
• 分蘖节
• EST
• SSR winter wheat
• Dongnongdongmai1
• low temperature stress
• tillering nodes
• EST
• SSR

利用抑制消减杂交技术构建东农冬麦1号分蘖节低温胁迫相关基因的cDNA正反文库,获得表达序列标签EST(Expressed sequence tag),经分析和前期处理后拼接得到736条非重复序列(Unigenes)。运用生物信息学方法对低温胁迫下诱导的冬小麦东农冬麦1号分蘖节相关EST-SSRs分布频率和碱基重复特点进行归纳分析。结果表明,736条Unigenes共检索到59个EST-SSRs,EST-SSRs出现频率为8.02%。EST-SSRs包括24种重复单元,其主要以三核苷酸和二核苷酸重复基元为主,二者分别占总SSRs 47.46%和44.07%,在EST中出现频率分别为3.80%和3...

• 出版日期2014
• 单位东北农业大学