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摘要
为了明确优良扁桃实生后代与传统主栽品种间的遗传进化关系，本实验采用GBS-seq技术对38个扁桃单株进行全基因组重测序，通过检测SNP位点并对进化关系、群体结构和主成分进行分析，来分析扁桃单株间的遗传关系。研究发现，1 088 481个高质量SNP位点大多位于基因上游、基因下游和基因间区，在外显子区域有SNP位点81 556个，在1号染色体上SNP位点的数量和平均密度最高。进化树结果表明，不同扁桃单株分为4类，结合群体结构和主成分分析，将第一类分入第一组，第二、三、四类分入第二组；品种矮丰、晚丰亲缘关系较近而与纸皮、双果、石头、叶尔羌亲缘关系较远，后四个品种中，石头、叶尔羌之间亲缘关系较近；11、14、18号单株与品种矮丰、晚丰亲缘关系较近，16、21、22号单株与双果亲缘关系较近，13号单株与纸皮、8号单株与石头巴旦、19号单株与叶尔羌之间亲缘关系较近。本研究通过对扁桃全基因组进行重测序，了解了38个扁桃单株间的遗传进化关系，为扁桃的品种选育，种质资源的收集和保存提供参考。
