红花ω3脂肪酸脱氢酶基因的分离及结构分析

作者：官玲亮; 陈郡雯; 刘千; 侯凯; 邵金凤; 吴卫

来源：植物遗传资源学报, 2013, 14(05): 908-917.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.2013.05.019

• 红花
• ω3脂肪酸脱氢酶
• RT-RACE
• 基因结构

采用RT-PCR和RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术,从红花叶片中分离到2个质体类ω3脂肪酸脱氢酶基因(CtFAD7和CtFAD8)的全长cDNA和1个微体类ω3脂肪酸脱氢酶基因(CtFAD3)的部分序列。将其在NCBI中进行序列比对,结果显示均与其他植物质体和微体ω3脂肪酸脱氢酶基因具有较高的相似性。氨基酸序列分析表明红花CtFAD3、CtFAD7和CtFAD8均含有3个富含组氨酸的保守结构域,分别为HDCGH、HXXXXXHRTHH和HVIHH,其中CtFAD7和CtFAD8的N-端分别含有56和27个氨基酸残基的质体信号肽序列。疏水性和跨膜分析表明,3个红花ω3脂肪酸脱氢酶氨基酸序列均包含4个疏水区域,分别跨膜1~3次。蛋白质二级结构预测结果表明,3个ω3脂肪酸脱氢酶蛋白主要由α螺旋和β折叠组成。通过对cDNA和DNA序列比较发现,CtFAD7和CtFAD8的DNA序列中均包含有7个内含子和8个外显子。各内含子的碱基序列和长度在物种间表现出丰富的多态性,在内含子出现的位置,均为该基因的保守区;而从第2#到7#外显子的长度和序列相似性在物种间非常保守。推测ω3脂肪酸脱氢酶基因的内含子对于保证基因在物种进化过程中功能的保守性起着关键作用。

• 出版日期2013
• 单位中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所; 四川农业大学