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摘要
为了解青海祁连有机牧场放牧藏羊和牦牛粪便中微生物多样性及动物间差异，本研究采用宏基因组方法分析了该地区采集的藏羊和牦牛粪便样本的物种DNA信息，经过NR数据库注释和以种水平为主的数据比较分析，获得了两种粪便中的细菌、古菌、真核微生物和病毒的目标数据。结果显示，藏羊粪便中有效序列数17 343 250条，在NR库中共注释物种数10 786种。牦牛有效物种序列数19 108 126条，共注释物种数8 774种。其中藏羊粪便中的细菌、古菌和病毒种数多于牦牛，而牦牛粪便中的真菌种数多于藏羊。两种动物粪便中细菌与古菌的最优势分类在门、纲、目、科和属上完全一致，仅在种水平不同。藏羊粪便中真核微生物最优势种是EMILIANIA＿HUXLEYI,而牦牛粪便中真核微生物最优势种是Trichuris＿trichiura,一种人兽共患寄生虫，这可能提示被采样牦牛群中存在这种寄生虫致病的风险。病毒方面只能确认分类到目水平，两种动物粪便中的病毒分类差异在属和种，但均为噬菌体，只是不同分型。
- 出版日期2022
- 单位青海大学农牧学院
