四引物扩增受阻突变体系PCR技术在中国明对虾SNP基因分型中的研究

作者：张建勇; 王清印; 王伟继; 孟宪红; 孔杰; 张全启

来源：中国水产科学, 2011, (04): 751-759.

• 单核苷酸多态性
• 基因分型
• 中国明对虾
• 四引物扩增受阻突变体系PCR single nucleotide polymorphisms(SNP)
• genotyping
• Fenneropenaeus chinensis
• tetra-primer ARMA-PCR

采用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)技术,对中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)的80个单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行验证。结果表明,通过优化PCR反应条件、调整内外引物浓度和采取Touchdown PCR程序可优化扩增效果,80组引物中有20组引物得到良好的分型效果。群体多态性分析表明有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量(PIC)的范围分别为1.127~1.993、0.136~0.607、0.119~0.492和0....

• 出版日期2011
• 单位中国水产科学研究院黄海水产研究所; 山东理工大学; 中国海洋大学