口蹄疫病毒单链抗体基因的构建及其推导蛋白三维结构的分子模拟

作者：刘涛; 周广青; 马军武; 林密; 祁淑芸; 冯霞; 马明仁

来源：中国兽医科学, 2009, (12): 1035-1040.

DOI：10.16656/j.issn.1673-4696.2009.12.002

• 口蹄疫病毒
• 单链抗体
• 重叠聚合酶链反应
• 序列分析
• 三维结构
• 分子模拟 foot-and-mouth disease virus
• single chain antibody(ScFv)
• over-lapping PCR
• sequence analysis
• 3D structure
• homology modeling

用口蹄疫病毒(FMDV)Asia1/JS/China/2005株灭活抗原免疫家兔,从兔脾细胞中提取RNA作为模板,通过PCR及重叠PCR方法构建出FMDV的单链抗体基因。测序结果显示,序列中有重链可变区(VH)及轻链可变区(VL)基因,经Blast比较,发现VH、VL的相似性最高分别可达81.0%和93.0%,且在序列中有连接VH及VL的柔性接头(Gly4Ser)3。用EXPASY软件包预测了推导蛋白的特性。运用Swiss-pdb viewer软件的SWISS-Model处理器对构建的单链抗体基因推导的蛋白序列进行了三维结构的分子模拟。拉马钱德兰图证明,所模拟的单链抗体的三维结构较为合理。

• 出版日期2009
• 单位农业部; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 中国农业科学院兰州兽医研究所