基于线粒体控制区D-loop序列的洪泽湖翘嘴鲌遗传多样性分析

作者：杨子萍; 李大命^*; 刘燕山; 谷先坤; 杨家新

来源：南京师大学报(自然科学版), 2023, 46(02): 70-76.

• 翘嘴鲌
• 控制区序列
• 遗传多样性
• 洪泽湖

为掌握洪泽湖翘嘴鲌(Culter alburnus)种质资源遗传多样性状况，采集洪泽湖6个群体共233尾翘嘴鲌，采用线粒体控制区D-loop全序列进行遗传多样性分析.结果显示，翘嘴鲌线粒体D-loop序列长度为934 bp～936 bp,碱基(A+T)含量(66.0%)明显高于(G+C)含量(34.0%). 243条D-loop序列检出23个变异位点，其中有9个单一信息位点，14个简约信息位点. 6个群体发现22个单倍型，全部群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为(0.794±0.019)和(0.002 51±0.000 14),呈现出高Hd和低Pi的遗传多样性模式. 6个群体中洪泽湖群体的遗传多样性最高(Hd:0.873±0.038,Pi:0.002 95±0.000 35),顾勒河群体的遗传多样性最低(Hd:0.709±0.064,Pi:0.002 03±0.000 31).分子方差分析表明，群体间的分子变异占比0.43%,群体内的分子变异占比99.57%,分子变异主要发生在群体内.群体间遗传分化指数Fst为-0.019 12～0.028 01(P>0.05),表明群体间没有出现遗传分化.单倍型系统进化树和单倍型网络结构图显示，群体间拥有多个共享单倍型，单倍型聚为一个进化分支，没有形成特定的地理遗传结构.中性检验结果表明洪泽湖翘嘴鲌群体没有经历显著种群扩张事件.研究结果表明，洪泽湖翘嘴鲌遗传多样性较低，6个群体间基因交流频繁，遗传分化不显著，可将6个群体作为一个管理单元进行保护，需采取措施提高翘嘴鲌遗传多样性及恢复其种群数量.

• 出版日期2023
• 单位南京师范大学; 江苏省淡水水产研究所