甘蔗SCL25基因的克隆与生物信息学分析

作者：刘娟; 吴嘉云; 刘少谋; 邓祖湖; 廖振阳; 符成; 李虎; 黄忠兴; 林彦铨; 陈如凯

来源：生物技术通报, 2013, (11): 51-57.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2013.11.004

• 甘蔗
• ScSCL25基因
• 克隆
• 生物信息学 Saccharumspp.ScSCL25Cloning Bioinformatics

结合电子克隆及RT-PCR获得了甘蔗(Saccharumspp.)花穗中表达的一个SR基因成员。该基因cDNA全长960 bp,包含编码209个氨基酸的开放读码框,gDNA序列长2 966 bp,包含5个内含子。同源性比对表明ScSCL25属于SCL亚家族,命名为ScSCL25(gb:JQ031566)。应用生物信息学工具分析表明:ScSCL25编码蛋白为不稳定亲水性蛋白,含有33个潜在磷酸化位点;无信号肽无跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核。该蛋白含有SR基因典型的RRM结构域和SR富集结构域,与玉米等作物的SR蛋白具有较高的同源性。

• 出版日期2013
• 单位广东省生物工程研究所（广州甘蔗糖业研究所）