大豆SNP分型方法的比较

作者：赵勇; 刘晓冬; 赵洪锟; 袁翠平; 齐广勋; 王玉民; 董英山

来源：分子植物育种, 2017, 15(09): 3540-3546.

DOI：10.13271/j.mpb.015.003540

• SNP分型
• Dt1
• CAPS
• KASP

本研究采用测序法、酶切扩增多态性序列法(CAPS)和竞争性等位基因特异性PCR(KASP)法对大豆Dt1基因的4个SNP进行分型,旨在从准确性、稳定性、耗时和成本4个角度,对上述3种分型方法进行比较。结果表明:3种SNP分型方法均可对大豆Dt1基因进行分型,但准确性存在差异,测序法的准确率最高(100%),其次为KASP法(94.3%),CAPS法较低(89.6%);从稳定性来看,测序法最稳定,KASP法次之,CAPS法最差;从耗时来看,KASP法最省时,其次是测序法,CAPS法最耗时;在成本上,相比其他两种方法,KASP法最经济。在具备相关仪器设备的条件下,KASP法是大豆快速、高效的SNP分型方法。

• 出版日期2017
• 单位吉林农业大学; 吉林省农业科学院; 吉林省农业科学院大豆研究所