侵染白术的大豆花叶病毒的全基因序列测定及分析

作者：马振男; 崔丽艳; 张丽; 王舒婷; 王德富^*; 牛颜冰^*

来源：中国生物化学与分子生物学报, 2022, 38(04): 515-526.

DOI：10.13865/j.cnki.cjbmb.2022.02.1630

• 大豆花叶病毒
• 白术
• 序列分析
• 系统进化分析

大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)是影响大豆产量与质量的重要病原体，且自然寄主范围窄。本研究对疑似感病白术叶片进行非序列依赖性扩增(sequence-independent amplification, SIA)检测，结果表明，感病白术为SMV侵染，并命名为SMV-Am。为明确其基因组结构特征及系统进化关系，本研究利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)提取、RT-PCR及RACE技术对其进行全基因组扩增，并进行生物信息学分析。结果表明，SMV-Am基因组全长9 587 nt,具有显著的马铃薯Y病毒属(Potyvirus)基因组结构特征；核苷酸与氨基酸序列相似性分析表明，SMV-Am与来自中国的SMV-Liaoning分离物相似性最高，核苷酸与氨基酸序列相似性分别为96.57%和98.86%;系统进化分析也显示与SMV-Liaoning分离物亲缘关系最近；对SMV-Am蛋白序列进一步分析发现，存在与功能位点相关的氨基酸突变，经I-TASSER和PyMOL软件进行蛋白建模分析，发现SMV-Am的P1、HC-Pro、P3、6K2、NIa-Pro、NIb蛋白结构均发生不同程度的变化，且P1蛋白最明显；重组分析结果显示，在SMV-Am基因组的6 560～8 950 nt位置存在重组事件，其主要亲本和次要亲本分别为SMV-XFQ012(GenBank登录号：KP710875.1)和SMV-pCB301-SC15(GenBank登录号：MH919386.1)。这是SMV侵染白术的首次报道，研究结果有望为防范SMV病害在白术上爆发流行以及防治提供科学依据。

• 出版日期2022
• 单位山西农业大学; 生命科学学院