K562细胞中N-乙酰基转移酶10的RNA结合图谱分析

作者：李高原; 王妍然; 王芳; 余佳^*

来源：基础医学与临床, 2023, 43(05): 739-744.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2023.05.0739

• N-乙酰基转移酶10
• K562细胞
• 紫外交联免疫沉淀测序技术(eCLIP-seq)

目的 对N-乙酰基转移酶10 (NAT10)在人慢性髓原白血病细胞系K562中的RNA结合图谱进行描绘。方法 利用紫外交联免疫沉淀技术(eCLIP)捕获NAT10在K562细胞中结合的转录本集合，对其进行高通量测序，并对数据进行生物信息学分析。通过peak-calling分析和对peaks进行注释，鉴定NAT10结合位点。并对所结合基因的类型和结合区域进行分析。进一步通过基因功能富集分析，探索其结合的RNA的功能。结果 NAT10主要结合于蛋白质编码基因的转录本，并在3′非翻译区域(3′UTR)富集，预测显示其结合的转录本与DNA损伤修复等功能相关。结论 NAT10可能通过与DNA损伤修复相关信使RNA(mRNA)的3′UTR区域结合，实现基因表达调控作用。

• 出版日期2023
• 单位医学分子生物学国家重点实验室; 中国医学科学院基础医学研究所; 北京协和医学院