大豆干旱胁迫下miRNA与mRNA荧光定量PCR内参基因的筛选

作者:刘伟灿; 王骐; 周永刚; 邓宇; 赵利旦; 王兴超; 靳京; 董园园; 王南; 王法微; 陈欢; 李晓薇; 李海燕
来源:西北农林科技大学学报(自然科学版), 2016, 44(02): 61-67.
DOI:10.13207/j.cnki.jnwafu.2016.02.009

摘要

【目的】通过分析大豆中候选内参基因的稳定性,筛选大豆干旱胁迫处理条件下适合成熟miRNA、前体miRNA及靶基因mRNA荧光定量PCR的内参基因。【方法】以干旱胁迫处理后的大豆根和叶片为材料,选择了5个成熟miRNAs和5个传统的看家基因作为候选内参基因,利用GeNorm和NormFinder程序对10个候选内参基因的稳定性进行评价。【结果】在干旱胁迫下,大豆根、叶片中,成熟miRNA定量最合适的单个内参基因分别为miR156a、miR167a,最合适的内参基因组合分别为miR1520d与miR156a、miR1520d与miR167a。前体miRNA和靶基因mRNA定量最合适的单个内参基因分别为Fbox、Act11,最合适的内参基因组合分别为Act11与Fbox、Act11与EF1A。【结论】筛选出大豆干旱胁迫条件下成熟miRNA、前体miRNA及其对应靶基因mRNA的荧光定量PCR的内参基因,最稳定内参基因数目为2个。

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