大豆苹果酸脱氢酶基因的电子克隆与生物信息学分析

作者：李文爽; 刘渊; 常文锁; 刘梦星; 李喜焕

来源：华北农学报, 2012, (03): 23-28.

• 磷高效基因
• 大豆
• 苹果酸脱氢酶
• 电子克隆 High phosphorus-efficiency related genes
• Soybean
• Malate dehydrogenase
• In silico cloning

利用电子克隆技术获得大豆中的苹果酸脱氢酶基因cDNA序列,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析和预测,为进一步克隆该基因、解决植物磷高效基因数量缺乏等问题提供依据。结果表明,大豆中的苹果酸脱氢酶基因(GmMDH1)cDNA序列长度为1 574 bp,开放阅读框1 230 bp,编码409个氨基酸残基;编码蛋白含有NAD bindingsite,Dimerization interface,Substrate binding site,MDH_glyoxysomal_mitochondrial结合位点和保守域,属于LDH_MDH_like Superfamily家族;亚细胞定位分析显示,编码蛋...

• 出版日期2012
• 单位河北农业大学