大肠杆菌基因中密码子前后碱基的使用与蛋白质结构

作者：张静; 顾宝洪; 石秀凡; 刘次全

来源：生物物理学报, 2001, (01): 174-180.

• 蛋白质二级结构
• mRNA
• 密码子前后碱基使用偏向
• 同义密码子 Secondary structure of protein
• mRNA
• Context base usage bias of codon
• Synonymous codon

对一组E.coli基因中编码蛋白质各类二级结构 (α -螺旋、β-折叠片、无规卷曲和回折 )的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较 ,发现一些密码子前后碱基的使用有偏向 ,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦表明 ,E.coli基因中同义密码子的选用与蛋白质的二级结构有一些关联。模型对于蛋白质结构预测算法的改进以及基因工程的研究有辅助作用。

• 出版日期2001
• 单位中国科学院昆明动物研究所; 云南大学