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摘要
随着大数据时代的来临,microRNA与基因的序列数据不断增加,如何从大量的数据中挖掘有生物学意义的信息成为新的热点问题。研究表明microRNA间以协作的方式在疾病中发挥作用,并呈现出网络的结构化趋势。因此,系统分析不同microRNA间的相似性将在疾病生物学标记挖掘等研究领域起到关键的桥梁作用。而microRNA通过调节其靶基因发挥作用,所以本研究将充分利用现有靶基因数据,从功能角度分析microRNA间的相似性。研究选取前期工作所得的靶基因优化列表,利用富集分析将基因集合转化为功能节点集合,并在此基础上利用集合相似性测度计算microRNA对在不同层面的功能一致性。结果表明,相同家族的microRNA倾向于调控相同或相似的靶基因;类比于非靶基因,microRNA靶基因倾向于共享较多相似的细胞组分,而在生物学通路及生物学过程中则具有相对较低的相似性。
- 出版日期2014
- 单位中国科学院深圳先进技术研究院
