为了研究多个印迹QTL(iQTL)定位方法，本研究采用随机交配策略对纯系自然群体构建可追溯亲本的永久F2作图群体，基于模拟SNP基因型数据与真实水稻SNP基因型数据生成表型性状数据，并应用混合线性模型进行多个iQTL定位和遗传效应的参数估计。模拟研究表明，在不考虑群体结构与亲缘关系造成的干扰时，基于纯系自然群体产生的永久F2作图群体可利用混合线性模型定位到小效应、低遗传率的iQTL，并能估计出iQTL的遗传效应，是一种行之有效的多iQTL定位方法。
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