基于转录组信息的绢毛委陵菜NAC转录因子家族

作者：王宇航; 许鑫钰; 周友财; 高冰; 冯郑红; 刘文博; 杨青杰^*; 吴建慧^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-11.

• 绢毛委陵菜
• NAC转录因子
• 生物信息学分析
• Cd胁迫

NAC是植物体中特有的转录因子，可以调节植物生长发育。本研究通过生物信息学技术在绢毛委陵菜(Potentilla sericea)的转录组数据中筛选出了29个NAC转录因子。结果表明：29个NAC转录因子被分成13个亚族，其中E，K亚族成员分别为12个，4个，A，B，D，J，M亚族成员各有2个，C，G，L亚族成员各有1个；29个NAC成员均为亲水蛋白，c407212.graph＿c0的理论等电点等于7；亚细胞定位显示，c401301.graph＿c0定位在细胞质和细胞核，c408496.graph＿c0定位在细胞质和内质网，其余均定位在细胞核内。绢毛委陵菜NAC家族中存在10种保守性较高的基序，组成了较为保守的结构域；基因表达量热图聚类分析显示，在Cd胁迫下NAC家族成员的基因表达量变化较大，各基因表达变化不一致。几乎所有的NAC基因在Cd胁迫后表达量都出现了上调或下调的变化，表明了这些基因可能参加了植物细胞对Cd胁迫的反应。这为进一步探究重金属胁迫下NAC转录因子功能提供了理论基础。

• 出版日期2023
• 单位东北林业大学