去势和非去势公猪背最长肌circRNA差异表达分析

作者:邢宝松; 王璟*; 陈俊峰; 马强; 任巧玲; 张家庆; 张华; 滑留帅; 孙加节; 曹海
来源:遗传, 2021, 43(11): 1066-1077.
DOI:10.16288/j.yczz.21-162

摘要

公猪去势可减少异味和打斗,但去势后产肉量和肌内脂肪沉积发生变化,其分子机制的解析对生产具有重要意义。近年来研究表明,环状RNA(circRNA)在肌肉发育中具有重要调控作用。为探究去势后circRNAs对背最长肌发育的调控,本研究选择6头淮南公猪,随机选择3头去势,当体重达130kg左右屠宰,采集背最长肌样品,利用高通量测序筛选差异表达circRNAs (differentially expressed circRNAs, DECs)并进行KEGG功能富集分析。结合前期筛选的公猪去势相关miRNAs,构建DECs-miRNAs调控网络,最后使用猪骨骼肌卫星细胞验证候选circRNA表达谱及其与miRNA互作关系。结果表明,去势和非去势组背最长肌样品共获得5866个circRNAs,两组之间共有370个DECs (|log2Foldchange|> 1, padj<0.8),KEGG富集分析表明,DECs来源母基因主要富集于肌肉发育、肌纤维类型转化、能量代谢等相关通路。构建的DECs-miRNA调控网络共包括69个circRNAs和8个miRNAs。选择circRNA2241和circRNA4237进行验证,结果发现这两个circRNAs真实存在且表达趋势与测序结果一致。进一步在猪骨骼肌卫星细胞初步验证circRNA2241与miR-1互作关系,结果表明睾酮显著促进circRNA2241表达,同时抑制miR-1表达。本研究结果提示circRNAs可能通过与miRNAs互作调控猪去势后背最长肌发育,从而为解析去势对肌肉发育调控的分子机制提供参考。

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