埃博拉病毒包膜糖蛋白二级结构及B细胞表位的预测

作者：赵玉娇; 黄新伟; 李多; 邱丽娟; 孙强明

来源：中国生物制品学杂志, 2015, (01): 30-34.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.000721

• 埃博拉病毒
• 糖蛋白
• 蛋白质二级结构
• B细胞表位 Ebolavirus
• Glycoprotein(GP)
• Secondary structure of protein
• B cell epitope

目的预测并分析从2014年西非埃博拉出血热暴发地区感染患者分离的扎伊尔型病毒株包膜糖蛋白(glycoprotein,GP)的二级结构及B细胞表位。方法通过Gen Bank搜索近期公布的分离自西非地区的扎伊尔型埃博拉病毒株基因组,获得GP1、GP2和s GP 3种包膜糖蛋白的基因及氨基酸序列,采用互联网服务器在线预测其二级结构及B细胞表位,并分析蛋白的各种氨基酸组成比例及可能的蛋白结合位点,通过亲/疏水性等参数判断氨基酸序列中可能暴露在蛋白结构表面或隐藏在内部的区段。结果在编码GP1、GP2和s GP的氨基酸中,占组成比例最多的均为苏氨酸。GP1和s GP可能的蛋白结合位点较多,且整个蛋白暴露于...

• 出版日期2015
• 单位中国医学科学院医学生物学研究所