甘油磷酸二酯酶家族蛋白的分子进化

作者：孙兰茜; 常平安; 曾鑫; 韩丽萍; 冉凤; 王超颖; 王玲; 黄飞飞

来源：基因组学与应用生物学, 2015, 34(01): 172-178.

DOI：10.13417/j.gab.034.000172

• 甘油磷酸二酯酶
• 分子进化
• 序列比对
• RNA剪接位点
• 跨膜结构域

甘油磷酸二酯酶(glycerophosphodiesterrase,GDE)是原核和真核生物中高度保守的一类酶,然而不同物种存在不同数量的蛋白成员。本文以8种模式生物的甘油磷酸二酯酶家族蛋白为基础,通过邻接法构建该家族的进化树,以了解GDE家族成员的进化关系。采用多序列比对、RNA剪接位点(外显子/内含子)分析以及跨膜结构域预测对所建树进行信息挖掘。通过上述方法,提出并初步验证了GDE家族分为3个亚族的观点,即第一亚族为GDE5,第二亚族包括GDE4和GDE7,第三亚族含有GDE1、GDE2、GDE3、GDE6四个成员。

• 出版日期2015
• 单位重庆邮电大学