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摘要
目的 通过生物信息学方法研究舌癌中干细胞相关的关键基因，并利用关键基因的生物学作用和功能富集初步探索舌癌干细胞关键基因的功能。方法 舌癌RNA-seq数据和相关临床信息从癌症基因组图谱(TCGA)下载。利用R语言分析舌癌病例，WGCNA用于模块化差异基因。基于mRNAsi确定重要舌癌干性相关的模块和关键基因。对关键基因GO以及KEGG功能富集。结果 在TCGA数据库中的差异表达分析显示，正常组织和舌癌组织的mRNAsi具有显著差异，舌癌组织明显要高于正常组织(P<0.05)。在生存分析中，观察到mRNAsi评分高的患者比mRNAsi评分低的患者总体生存更差(P<0.05)。基于mRNAsi确定了40个关键基因，GO以及KEGG功能富集发现关键基因都集中在细胞周期、范可尼贫血通路和Wnt通路，P<0.05,FDR<0.25。结论 舌癌患者的mRNAsi高评分可能预示着预后不良，mRNAsi在舌癌的发生发展中起着重要的作用，并以此鉴定了40个舌癌干性相关的关键基因，这些基因有望成为舌癌治疗的靶点。
- 出版日期2023
- 单位右江民族医学院附属医院; 右江民族医学院
