基于SSR标记的山东地方鸡种遗传多样性和群体遗传结构分析

作者：周艳; 雷秋霞; 韩海霞; 刘杰; 李福伟; 刘玮; 王杰; 李大鹏; 曹顶国^*

来源：农业生物技术学报, 2023, 31(01): 115-123.

• 山东
• 鸡
• 地方品种
• 微卫星
• 遗传多样性

为评估山东省地方鸡(Gallus gallus)种质资源遗传多样性现状，为山东省地方鸡种质资源管理及创新利用提供科学参考依据，本研究利用20对微卫星标记对6个山东省地方鸡种、1个培育品系以及1个省外鸡种共计480个个体进行基因分型，采用软件分析山东省地方鸡种的遗传多样性和群体遗传结构。结果表明，20个多态位点在8个群体中共检测到226个等位基因，平均每个位点11.3个，PIC为0.711。群体平均等位基因为6.625个，观测杂合度(observed heterozygosity, Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity, He)的平均值分别为0.579和0.666。分子方差分析结果显示，8个鸡群体间变异为18%，群体内变异为82%，遗传变异主要来自于群体内不同的个体间。聚类分析和主成分分析(principal coordinates analysis, PCoA)结果具有一致性，8个群体被分为3大类，济宁百日鸡(JB)、莱芜黑鸡(LH)、鲁禽鸡(LQ)、琅琊鸡(LY)、鲁西微型鸡(LL)和寿光鸡(SG)率先聚为一类，石歧杂鸡(SQ)和汶上芦花鸡(WL)均单独聚为一类。研究表明，8个群体均具有丰富的遗传多样性，分类结果与各品种地理位置分布以及相互关系基本一致，本研究为山东省地方鸡种的保护、评价及开发利用提供重要的理论依据。

• 出版日期2023
• 单位山东省农业科学院