大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星序列的开发与分析

作者：李猛; 马爱军; 岳亮; 邹杰; 王广宁; 田岳强; 马本贺; 夏丹丹

来源：海洋与湖沼, 2013, (05): 1365-1371.

• 大菱鲆
• 微卫星标记
• 标记开发
• 序列分析
• 标记初筛 turbot Scophthalmus maximus
• microsatellite markers
• marker isolation
• sequence analysis
• pre-liminary screening

采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats)法和标记初步筛选法,进行了大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星标记开发的研究,分析了大菱鲆基因组中微卫星DNA序列的特征,并进行了拟作图标记的初步筛选。结果表明,FIASCO法的富集效率为78.56%,二次筛选出655个阳性克隆,测序后经分析有469条含有微卫星位点的单一序列,共得到597个微卫星位点。其中完美型占51.76%,非完美型占34.67%,复合型占13.57%;核心序列的重复次数在3—96次之间,平均重复数为13.39次;重复单元类别最...

• 出版日期2013
• 单位上海海洋大学; 中国水产科学研究院黄海水产研究所