基于比较转录组学分析菜用甘薯对重金属镉响应的分子机制

作者：董鹏程; 袁泽; 刘晗; 李建民; 陈赞明; 秦春; 史良; 陈亚华^*

来源：江苏师范大学学报(自然科学版), 2023, 41(03): 21-2.

• 菜用甘薯
• 镉
• 转录组测序
• KEGG富集分析
• 金属转运蛋白

菜用甘薯由于其独特的食用部位，比其他甘薯品种具有更高的营养价值，日益严重的重金属镉(Cd)污染问题使得菜用甘薯的安全生产面临挑战，而Cd在甘薯中积累和转运的分子机制仍然未知.采用转录组测序技术研究福菜薯18号，总计获得64 295个单基因的转录本，并确定了可食用部位(茎和叶)在Cd胁迫下差异表达的基因(DEGs),其中1 946个在茎中差异表达，1 414个在叶中差异表达.京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析表明，茎和叶中的DEGs同时富集到4种生物途径中，包括苯丙烷生物合成途径、淀粉和蔗糖代谢途径、植物MAPK信号途径和氮代谢途径.另外，被注释为金属转运蛋白的一类DEGs可能参与甘薯对Cd的吸收和转运，实时荧光定量PCR结果表明，IbABCB26、IbABCF4、IbABCG6、IbNRAMP1、IbHIPP7、IbHIPP24、IbYSL1等金属转运蛋白基因的表达受Cd诱导显著上调，其功能有待进一步研究确定.这些发现将有助于进一步探明菜用甘薯中Cd积累的分子机制，并为其安全生产提供理论支持.

• 出版日期2023
• 单位生命科学学院; 南京农业大学