麦洼牦牛基因组三碱基重复微卫星的挖掘及其遗传多态性分析

作者：罗辉; 赵芳芳; 孙磊; 伍仕鑫; 徐传飞; 蔡欣

来源：中国畜牧兽医, 2017, 44(05): 1438-1445.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.05.026

• 麦洼牦牛
• 三碱基
• 微卫星位点
• 遗传多态性

为了解麦洼牦牛现有群体的遗传多样性及种群遗传分化特征,试验通过生物信息学方法从已公布的牦牛基因组中筛选到9 466个三碱基重复微卫星位点,以191个麦洼牦牛基因组DNA样品为模板对各个位点进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳基因分型。经过哈迪-温伯格平衡检验,在15个三碱基微卫星位点中,有5个位点偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.05)。15个微卫星位点均为高度多态性(PIC>0.5),群体平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)分别达到0.5041、0.8152和0.7831。进一步通过Structure 3.0软件分析发现,麦洼牦牛群体结构单一,无分化特征,表明麦洼牦牛品种虽然具有较高的遗传多态性但是无分化迹象。

• 出版日期2017
• 单位西南科技大学