青海上北山林场野生桃儿七根部内生真菌群落组成及多样性研究

作者：宁祎; 李艳玲; 周国英; 杨路存; 徐文华

来源：中国中药杂志, 2016, 41(07): 1227-1234.

DOI：10.4268/cjcmm20160712

• 桃儿七
• 内生真菌
• 高通量测序
• 群落组成
• 多样性

该研究通过应用第二代测序技术(NGS),即高通量测序方法测序青海野生桃儿七根内真菌宏基因组ITS 1区,并依据RDP中设置的分类阈值对处理后的序列进行物种分类,鉴定内生真菌的群落组成。研究结果显示,测序结果经过质量控制共获得有效条带22 565条,依据97%的序列相似性做聚类相似性分析,获得全部样品的可分类操作单元(OTUs)共517个,RDP分类依据0.8的分类阈值鉴定出的全部真菌可归类为13纲、35目、44科、55属。3个样品LD1,LD2,LD3中共同的优势属真菌为Tetracladium属(所占比例分别为35.49%,68.55%,12.96%),样品的香浓多样性指数和辛普森多样性指数分别在1.752.92,0.110.32。研究结果表明,青海上北山林场野生桃儿七根内内生真菌具有较高的多样性和较复杂的群落组成,蕴含着丰富的内生真菌资源,且高通量测序技术对于研究植物内生真菌群落组成及多样性具有显著的优势。

• 出版日期2016
• 单位中国科学院; 中国科学院生态环境研究中心; 中国科学院西北高原生物研究所; 中国科学院大学