代谢途径参数估计的智能优化算法比较

作者：余永红; 冯斌; 孙俊

来源：计算机与应用化学, 2010, (07): 897-900.

DOI：10.16866/j.com.app.chem2010.07.010

• 智能优化算法
• 代谢途径
• 参数估计 intelligent optimization algorithm
• metabolic pathway
• parameter estimation

本文讨论了非线性动力生化过程的参数估计(反问题),以1个包含36个参数的3阶段代谢途径为研究对象,其数学模型描述为受1组非线性代数-微分方程约束的非线性规划问题,由于频繁的病态和多峰值,传统的算法(如梯度算法)并不能得到满意的解。智能优化算法由于其高效性、收敛性和鲁棒性等特点被广泛应用于非线性问题优化,于是提出利用智能优化算法求解代谢途径的参数估计,利用算法的非线性逼近能力,建立求解参数估计的算法模型,采用人工模拟实验值,通过改变已知参数值增加试验次数减少实验误差,将参数编码成算法的1组解向量,以实验值和预测值的误差平方加权的和为目标优化函数。仿真试验表明用量子粒子群算法求解较好,该算法有效地...

• 出版日期2010
• 单位江南大学