新疆天山雪莲转录组注解知识库

作者：李锦; 严潘瑶; 钱飞箭; 邱宝义; 夏雯雯; 牟晓威; 邱丽娟; 林忠平; 陈铭; 祝建波; 陈贤丰

来源：植物学报, 2017, 52(04): 530-538.

DOI：10.11983/CBB16113

• 天山雪莲
• 知识库
• 转录组
• 低温
• 抗逆
• 功能基因

新疆天山雪莲(Sasussured involucrata)具有较高的极端低温耐受特性,为低温耐受机制研究提供了一种非常好的模式植物。新疆天山雪莲转录组注解知识库(http://www.shengtingbiology.com/Saussurea KBase/index.jsp)是基于网络数据资源的综合性数据库,由html、Perl、Perl CGI/DBD/DBI、Java和Java Script编程所设计的前端界面和用于数据存取、注释及管理的后端数据库管理系统Postgrel SQL构成。知识库包含基因组数据、转录组原始数据、质量控制数据、GC含量、功能基因序列及注释、功能基因代谢通路、功能基因的注释统计、雪莲与其它物种的转录组或基因组比较分析数据和生物分析软件包等资源。该数据库不仅有利于低温功能基因组学及低温耐受机制研究,而且为冷耐受性状物种的分子育种提供基因资源平台和理论依据。

• 出版日期2017
• 单位北京大学; 中国农业科学院作物科学研究所; 浙江大学; 生命科学学院; 石河子大学