联合分析HCV种属信息区和高度保守区序列确定广东地区HCV基因型和亚型

作者：黄辉红; 周元平; 杨洁; 曾艳丽; 魏君锋; 彭劼; 吴英松; 黎诚耀; 刘叔文; 侯金林

来源：广东医学, 2010, 31(07): 825-828.

DOI：10.13820/j.cnki.gdyx.2010.07.024

• 丙型肝炎病毒
• 基因型
• 亚型
• 系统进化树分析

目的扩增HCV种属信息区NS5B和高度保守区5-UTR基因序列,用系统进化树法深入分析HCV基因型和亚型,阐明广东地区丙型肝炎患者HCV基因型和基因亚型的特点。方法采集99例慢性丙型肝炎病例血清,应用RT-PCR技术分别扩增HCVNS5B区和5-UTR特定片段,测序后进行系统进化树分析,确定HCV基因型及亚型。结果99例患者标本均准确分型,其中NS5B区段分型74例,5-UTR区段分型99例。HCV基因型和亚型的分布:1a亚型1例、1b亚型59例、1型7例、2a亚型11例、3a亚型3例、3b亚型2例、3型3例、6a亚型13例;另有2例标本在两区段分型不同,5-UTR/NS5B区段分型分别为6a/1b和3a/1b。两区段共同分型74例,72例标本在两区段基因型一致,2例标本在两区段基因型不同,为HCV重组体。结论联合分析HCV不同区段基因序列,可提高HCV基因分型的准确度及灵敏性。广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主;其次为6a和2a;3型中的a、b亚型也占有一定比例。

• 出版日期2010
• 单位南方医科大学南方医院; 南方医科大学