等位基因功能差异的统计遗传学分析及应用

作者：胡文明; 阚海华; 王伟; 徐辰武

来源：作物学报, 2013, (01): 72-79.

• 等位变异
• 超饱和模型
• 变量选择
• E-Bayes Allelic variation
• Oversaturated model
• Variable selection
• E-Bayes

等位基因的变异在各种生物中都是普遍存在的,并对基因的表达起着重要的调控作用。为了探索关联分析中品种数目(A)、平均等位基因多态信息含量(B)和候选基因总贡献率(C)对候选基因分析结果的影响,本研究采用经验贝叶斯(E-Bayes)方法探讨了上述因素对候选基因检测功效、遗传效应估计值的准确度和精确度以及假阳性出现频率等的影响。结果表明:(1)随着A、B和C的增加,候选基因的检测功效和效应估计值的准确度和精确度明显提高,假阳性出现的频率降低。(2)B对检测功效有显著的影响。在B值保持较高的水平时,即使品种的数目保持较低的水平以及候选基因的总贡献率较低时,平均检测功效也可达到80%;当B值为中等水平时...

• 出版日期2013-9-29
• 单位扬州大学