宁波三江口水域原核生物群落结构分析

作者：胡安谊; 李姜维; 杨晓永; 王弘杰; 于昌平

来源：环境科学, 2015, 36(07): 2487-2495.

DOI：10.13227/j.hjkx.2015.07.022

• 甬江流域
• 原核生物群落
• 16S rRNA基因-Illumina Miseq测序
• 污染指示菌
• 潜在病原菌
• 生物信息分析

首次应用16S rRNA基因-Illumina Miseq高通量测序技术对甬江流域宁波三江口区域的表层水体原核生物群落进行了分析,共获得215 504条高质量序列.多样性指数分析表明,该流域的水体原核生物群落具有较高的遗传多样性和丰富度.菌群分类分析发现,β-变形菌纲(β-Proteobacterium)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是主要的优势菌群,其相对丰度占总群落的78.88%.对比不同站位的原核生物群落,发现水文环境可能是影响三江口水域原核生物群落组成和结构的重要因素之一.与以往报道对比分析表明,甬江流域分布有多种污水和粪便污染指示菌,其中余姚江污染指示菌的丰度最高,说明其受污染的风险可能较高.病原菌BLASTN分析表明,在种和亚种水平上,分别检出76和18种潜在病原菌,占序列总量的2.19%和0.40%.本研究为系统认识甬江流域原核生物群落结构及生态功能提供了重要基础数据.

• 出版日期2015
• 单位中国科学院城市环境研究所; 中国科学院大学