基于生物信息学分析核糖体蛋白S7与乳腺癌预后和免疫浸润的关系

作者:方倩倩; 沈国双*; 解琪琪; 赵福星; 任登峰; 刘震; 王淼舟; 赵久达
来源:中国高原医学与生物学杂志, 2023, 44(02): 132-144.
DOI:10.13452/j.cnki.jqmc.2023.02.008

摘要

目的 基于生物信息学分析核糖体蛋白S7(RPS7)与乳腺癌预后和免疫浸润的关系。方法 从TCGA数据库获取乳腺癌表达谱数据及相关临床数据,然后使用TCGA、UALCAN、HPA、STRING、TIMER数据库和Kaplan-Meier法分析RPS7与乳腺癌预后和免疫浸润的关系。结果 RPS7在乳腺癌中低表达,并与年龄和雌激素受体(Estrogen Receptor, ER)状态、孕激素受体(Progesterone Receptor, PR)状态及PAM50显著相关。RPS7高表达的患者与预后不良显著相关。通过功能富集分析表明,RPS7的生物学功能主要富集在角质化作用方面,分子功能主要富集于肽链内切酶抑制剂活性方面。经KEGG分析发现,RPS7可能影响神经组织的交互作用和蛋白质的消化吸收途径。此外,RPS7表达与B细胞、树突状细胞、调节性T细胞、CD8+T细胞和T细胞的免疫浸润水平呈显著正相关。结论 RPS7可能为一种新的与乳腺癌预后和免疫浸润相关的生物标志物。

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