青海省2016—2018年婴幼儿星状病毒流行情况和基因型分析

作者:刘桂香; 范丽霞*; 田登; 徐琼; 赵生仓; 张华一; 丰艳丽; 肖敬玉
来源:中华实验和临床病毒学杂志, 2022, 36(01).

摘要

目的了解2016—2018年星状病毒基因型流行情况, 为防治星状病毒感染引起的疾病提供实验依据。方法用星状病毒实时荧光PCR试剂盒进行星状病毒阳性核酸的筛查。用星状病毒特异性引物Mn289/270进行RT-PCR扩增, 阳性产物回收纯化并直接测序, 用Clustal和MEGA3.0生物软件对星状病毒序列进行序列比对和系统进化分析。结果 496例儿童腹泻中病毒性腹泻136例, 占17.4%, 其中17例检测到星状病毒, 占3.4%;男性多于女性;年龄分布均是5岁以下儿童, 而且小于1岁的儿童12例, 占70.58%(12/17);在地区分布上, 西宁市占64.70%(11/17)、湟中县占29.41%(5/17)、黄南州占5.88%(1/17)。从标本收集的时间分布来看, 阳性病例主要集中在4~6月份, 到10~12月又有一个小高峰。7个核酸片段经过测序, 6个为基因型1型、1个为基因型2型, 在基因1型中4个核酸片段间的同源性为99.0%~100%, 与同一型别的其他2个核酸片段的同源性为在88.4-95.7%之间。结论青海省2016—2018年引起婴幼儿腹泻的星状病毒以HAstV-1型为主, 同时还存在HAstV-2基因型。

  • 出版日期2022
  • 单位青海省疾病预防控制中心