一个杂合错义变异所致遗传性蛋白C缺陷症家系的表型与基因型分析

作者：丁红香; 李姗姗; 朱丽丹; 徐晓杰; 倪莉; 江明华^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2021, 38(11).

• 遗传性蛋白C缺陷症
• 基因变异
• 生物信息学
• 蛋白质模型

目的分析1个遗传性蛋白C(protein C, PC)缺陷症家系的表型和基因变异。方法检测先证者及其家系成员(共3代7人)的血浆蛋白C活性(protein C activity, PC:A)、蛋白C抗原(protein C antigen, PC:Ag)含量及其他凝血指标。用PCR对先证者PROC基因的9个外显子及其侧翼序列进行扩增, 将产物纯化后进行直接测序。对候选变异通过反向测序进行验证, 并对家系其他成员的相同位点进行检测。用生物信息学软件分析变异的致病性和保守性。用Swiss-PdbViewer软件分析蛋白质三维模型以及变异氨基酸之间的相互作用。结果先证者及其祖母、父亲和哥哥的PC:A和PC:Ag分别降至55%、52%、48%、51%和53%、55%、50%、56%。测序分析显示, 上述成员PROC基因的第9外显子均存在c.1318C>T(p.Arg398Cys)杂合错义变异。MutationTaster评分为0.991、PROVEAN为评分-3.72、FATHMM为评分-2.49, 均提示为有害变异;保守性分析显示Arg398在同源物种间呈弱保守性;蛋白质模型分析显示变异前Arg398与Glu341和Lys395各形成1个氢键, 变异为Cys398后与Glu341之间的氢键消失, 与Lys395之间则增加了1个氢键, 使蛋白质的结构发生了改变。结论先证者PROC第9外显子c.1318C>T(p.Arg398Cys)杂合错义变异可能是导致该家系PC:A和PC:Ag减少的原因。

• 出版日期2021
• 单位温州医科大学附属第二医院