摘要

本研究对朝仓花椒进行转录组测序,建立转录组数据库并进行比对和注释,获得朝仓花椒ARF基因家族序列信息,利用MEGA、MEME和DNAMAN等软件进行分析,并研究了部分ARF基因表达特征。结果表明,朝仓花椒共鉴定出23个ARF基因,进化上可分为6类,每组成员数量分别为6、1、7、3、3和3。结构域分析发现,朝仓花椒ARF蛋白具有保守DBD、AuxRE和AUX/IAA结构域,也有部分ARF蛋白仅含有1个或2个结构域。Real-time PCR结果表明,朝仓花椒ARF基因在植株根、茎、叶、花和果中均有表达。

  • 出版日期2020
  • 单位生命科学学院; 贵州省农业科学院; 农业部; 贵州大学

全文