口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较

作者：吕律; 杨帆; 何继军; 靳野; 郭建宏; 郑海学; 刘湘涛

来源：中国兽医科学, 2014, 44(02): 111-118.

DOI：10.16656/j.issn.1673-4696.2014.02.001

• 口蹄疫病毒
• 全基因组
• S片段
• 致病性

为了查明我国新流行的口蹄疫病毒(FMDV)O型Mya98谱系猪源和牛源毒株的序列差异,采用RT-PCR方法,对FMDV O型Mya98谱系牛源毒株(O/BY/CHA/2010)和猪源毒株(O/GZ/CHA/2010)的基因组全序列进行了扩增和测序,并与O型其他牛源和猪源参考毒株的基因组进行了比较分析。结果显示,O/BY/CHA/2010毒株和O/GZ/CHA/2010毒株都属于SEA拓扑型的Mya98谱系毒株。O/BY/CHA/2010毒株和O/GZ/CHA/2010毒株与来自Mya98谱系的其他毒株的全基因的核苷酸同源性大于98.0%。除了VP4、2A和3BCD区,O/BY/CHA/2010毒株和O/GZ/CHA/2010毒株与Mya98谱系的其他毒株的其他基因区的同源性较低。与非SEA拓扑型毒株(UKG/7B/2007、Akesu/58和PanAsia谱系毒株)相比,在2A、P2和3CD区,具有较高的同源性,表明O/BY/CHA/2010和O/GZ/CHA/2010可能具有这些毒株的生长特性。进一步的序列分析表明,O/GZ/CHA/2010毒株在L蛋白第10位增加了1个亮氨酸,在S片段缺失70个核苷酸。试验结果为进一步分析氨基酸插入和核苷酸缺失对毒株致病性的影响奠定了基础。

• 出版日期2014
• 单位中国农业科学院; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 中国农业科学院兰州兽医研究所