不同辣椒品种(系)苗期根际细菌群落结构分析

作者:王灿; 苏甜; 张新梅; 李子薇; 许俊强; 王绍祥; 张应华*
来源:西南农业学报, 2023, 36(08): 1636-1643.
DOI:10.16213/j.cnki.scjas.2023.8.007

摘要

【目的】为明确不同辣椒品种(系)苗期根际细菌群落结构的差异性,探讨地方品种辣椒和人工选育辣椒根际细菌群落特性,挖掘可能对地方品种定殖起关键作用的细菌群类。【方法】以云南文山地区地方辣椒品种(WG1、9F33)和人工选育品系(Y19278、Y19292)为研究对象,运用16S rDNA分析不同品种(系)对其根际细菌群落结构的影响。【结果】4个辣椒品种(系)根际细菌的Ace指数在370.82~376.48,Chao1指数在371.23~380.32,均显著(P<0.05)高于种植前土壤的309.24和308.24。种植前土壤的Shannon指数是6.7315,显著(P<0.05)低于种植辣椒后土壤的Shannon指数(7.059~7.276)。主坐标分析(Adonis:R2=0.896,P=0.001)中地方品种WG1和9F33辣椒与人工选育品系Y19278、Y19292辣椒根际土壤细菌群落结构差异显著(P<0.05)。在地方品种WG1和9F33辣椒中显著富集的细菌群落有鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、Pseudolabrys、Ellin6067、芽单胞菌属(Gemmatimonas)。在人工选育品系Y19278、Y19292辣椒中显著富集的细菌是Steroidobacter。基于同源蛋白簇数据库对不同处理细菌群落基因功能进行注释,共得到22类功能类别。除未知功能外排名前5的基因功能类别分别是E类(氨基酸运输和代谢)丰度之和达2094 582.07;J类(翻译、核糖体结构和生物合成)丰度之和达1574 284.59;C类(能量产生和转换)丰度之和达1523 953.07;M类(细胞壁、细胞膜和膜结构的生物合成)丰度之和达1523 661.89;P类(无机离子转运与代谢)丰度之和达1248 954.54。其中地方品种WG1基因功能丰度均显著(P<0.05)高于其他品种(系)辣椒,尤其在运输与代谢方面。【结论】种植不同品种(系)辣椒均显著提高土壤细菌群落多样性和丰富度。地方品种辣椒(WG1、9F33)和人工选育品系辣椒(Y19278、Y19292)根际细菌群落结构存在显著差异,其之间出现显著丰度差异的根际细菌类型。此外相较于人工选育品系,地方品种WG1对根际细菌群落生命活动具有较高的诱导和促进作用,表现在运输与代谢相关的基因功能中。对于下一步开发针对地方品种辣椒专用生物菌肥、土壤改良剂和生物药具有指导意义。

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