多尺度组分特征和位点关联特征相融合的剪接位点识别

作者：周雄

来源：计算机工程与应用, 2014, (10): 120-123+187.

• 剪接位点
• 最小二乘支持向机
• 位点关联特征
• 多尺度组分特征 splice sites
• least squares support vector machine
• adjacent positions relationship features
• multi-scale component features

为了提高剪接位点的识别精度,提出一种多尺度组分和位点关联特征相融合的剪接位点识别模型(MSC-APR)。确定剪接位点序列保守性的窗口长度,分别提取序列的多尺度组分和位点关联特征,然后将两类特征组合输入最小二乘支持向量机构建剪接位点分类器,采用数据集HS3D和NN269进行仿真实验。结果表明,MSC-APR的剪接位点识别精度明显优于对比模型的识别精度。

• 出版日期2014
• 单位重庆工商大学