AS-PCR检测ABCG2 34G>A多态性

作者:李泰霖; 谢海棠; 许标波; 彭艳; 万子睿; 孙红; 曾樱; 沈杰; 王果; 朱院山
来源:中国临床药理学与治疗学, 2014, 19(10): 1111-1115.

摘要

目的:建立和优化检测ABCG2 34G>A多态性的等位基因特异性PCR方法(allele-specific PCR,AS-PCR),并对100例健康受试者进行分型检测。方法:设计合成3'-末端错配引物和包含内部错配位点的3'-末端错配引物,进行AS-PCR扩增,比较两者的扩增特异性,应用AS-PCR检测100例健康受试者ABCG2 34位多态型,采用焦磷酸测序方法(pyrosequencing)进行抽样验证。结果:含有第3位内部错配位点的3'-末端错配引物扩增特异性明显优于含有第2位内部错配位点以及不含内部错配位点的3'-末端错配引物。100例样本AS-PCR分型结果与同批标本前期的焦磷酸测序结果一致。ABCG2 34AA,34GA和34GG型频率分别为7%、32%、61%。结论:本文所建立的AS-PCR方法在进行ABCG2 34位多态分型时,具有省时、快速和成本低等优点,经过在引物中引入内部错配位点等优化设计后,分型结果准确可靠,适合临床应用。