三维氨基酸描述子(SVTD)在HLA-A~*0201限制性CTL表位肽QSAR中的应用

作者：陈婷; 李美萍; 张生万

来源：计算机与应用化学, 2011, (01): 78-82.

• 三维氨基酸描述子SVTD
• 表位肽
• 多元线性回归
• 定量构效关系模型 SVTD
• epitope
• multiple linear regression
• QSAR

应用新型的三维氨基酸描述子-SVTD对65个HLA-A~*0201限制性CTL表位肽进行结构表征,通过多元线性回归对其结构与活性的关系建立定量构效关系QSAR模型,采用内外双重验证的办法分析验证模型的稳定性,建模计算值,留一法(leave-one-out,LOO)交互检验预测值和外部样本预测值的相关系数R,R_(cv),Q_(ext)分别为:0.949,0.899,0.922。表明SVTD描述子能够系统地表征肽与生物活性相关的结构,且所产生的定量构效关系模型,预测HLA-A0201活性的能力较好,可以为改造CTL表位肽结构提供理论基础。

• 出版日期2011
• 单位山西大学